بالرغم من فوائد النعناع الكبيرة إلا أن الدراسات العلمية أثبتت وجود العديد من الأضرار، حيث يتسبب في حالات بحساسية الفم، لدى الأشخاص الذين يعانون من التهاب الشفاه الزاوي.
- عند الاستخدام الموضعي لزيت النعناع، أو استعمال معجون أسنان يحتوي على النعناع.
-هناك أشخاص يعانون من فقدان حمض المعدة، فهذا قد يذيب الغلاف في وقت مبكر من عملية الهضم.
-يتسبب النعناع قد يسبب حرقة المعدة كما يتسبب زيت النعناع في الحرق الشرجي لدى الأشخاص الذين يعانون من الإسهال.