زار الرئيس الراحل محمد حسني مبارك، في حقبته الرئاسية التي استمرت 30 عامًا، الكنيسة، 5 مرات في عهد قداسة البابا الراحل شنودة الثالث بابا الإسكندرية وبطريرك الكرازة المرقسية.
وتبرز "البوابة نيوز" المرات التي دخل الرئيس مبارك فيها، الكنيسة، كالتالي:
كانت أول مرة داخل الكنيسة المعلقة عام 1984 وكان البابا شنودة تحت التحفظ، وأربع مرات لحضور صلوات الجنازة لأربعة من مشاهير الأقباط وهم
"فؤاد عزيز غالي، قائد الجيش الثاني عام 2000، والصحفي سعيد سنبل، في ديسمبر 2004، والمناضل فكري مكرم عبيد في فبراير 2006، والمستشار حنا ناشد"،
وكان أغلب الأحيان يزور نجل الرئيس الراحل جمال وعلاء مبارك الكنيسة في الأعياد والمناسبات الدينية.
