ولد الدكتور مجدى يعقوب في 16 نوفمبر 1935 في بلبيس بمحافظة الشرقية لأسرة مسيحية أرثوذوكسية لها أصول من محافظة أسيوط، ودرس الطب في جامعة القاهرة المصرية حيث عمل كطبيب عام 1957.
قرر الدكتور مجدى يعقوب التخصص في طب القلب بعد وفاة عمته بمرض القلب في العشرينيات من عمرها.
انتقل الدكتور مجدى يعقوب إلى بريطانيا عام 1962، ثم أكمل دراسته في شيكاجو بالولايات المتحدة، وفي عام 1973، عمل الدكتور مجدى يعقوب كاستشاري لجراحة القلب في مستشفى هيرفيلد بلندن.
وفي عام 1974، أجرى الدكتور مجدى يعقوب عملية قلب مفتوح في نيجيريا، ويعمل الدكتور مجدى يعقوب الآن أستاذ في الكلية الإمبريالية للعلوم بلندن، كما قام أيضًا بتأسيس مركز الدكتور مجدى يعقوب لأمراض وأبحاث القلب بأسوان.
